НАН Беларуси имеет в своей организационной структуре семь отделений:

Отделение Академии наук в своей деятельности подотчетно Общему собранию, Президиуму и Бюро Президиума Академии наук, а также Председателю Президиума Академии наук в пределах их компетенции и выполняет следующие основные функции:

• обеспечивает развитие и координацию фундаментальных и прикладных научных исследований и разработок в соответствующих областях науки;
• вносит предложения по формированию программ фундаментальных и прикладных исследований и разработок, контролирует ход их выполнения, оценивает результаты этих исследований и разработок, а также уровень подготовки научных кадров в научных организациях, закрепленных за отделением;
• разрабатывает предложения об ускорении научно-технического прогресса и о социально-экономическом развитии Республики Беларусь;
• анализирует эффективность международного научного сотрудничества научных организаций, закрепленных за отделением;
• устанавливает и осуществляет научные связи с министерствами, иными республиканскими органами государственного управления, другими государственными организациями, подчиненными (подотчетными) Президенту Республики Беларусь или Совету Министров Республики Беларусь, научными организациями и учреждениями, обеспечивающими получение высшего образования, творческими союзами и ассоциациями Республики Беларусь и других государств.

Высшим коллегиальным органом управления отделения НАН Беларуси является общее собрание отделения, членами которого являются: академик-секретарь отделения; академики и члены-корреспонденты, состоящие в отделении; руководители научных организаций отделения, не являющиеся членами Академии наук; представители научных организаций, закрепленных за отделением Академии наук, а также научных организаций министерств, других республиканских органов государственного управления, учреждений, обеспечивающих получение высшего образования, по профилю их научной деятельности, избранные в состав Общего собрания Академии наук в соответствии с Уставом НАН Беларуси; ученый секретарь отделения.

Сессия общего собрания отделения Академии наук созывается по мере необходимости, но не реже двух раз в год. В период между сессиями общего собрания отделения работой отделения Академии наук руководит бюро отделения, которое избирается общим собранием отделения по представлению академика-секретаря и состав которого утверждается Президиумом Академии наук.