За Аддзяленнем замацаваны наступныя асноўныя напрамкі дзейнасці:

• вывучэнне механізмаў функцыянавання сістэм арганізма ў норме і пры паталогіі;
• распрацоўка новых метадаў дыягностыкі неінфекцыйных захворванняў, дыягнастычных прыбораў
• эксперыментальнае абгрунтаванне новых прынцыпаў і метадаў лячэння нервовых, псіхічных, сардэчна-сасудзістых, страўнікава-кішачных і іншых захворванняў;
• заканамернасці цячэння паталагічнага працэсу;
• распрацоўка новых лячэбных, дыягнастычных, прафілактычных і рэабілітацыйных тэхналогій, медыцынскай тэхнікі і вырабаў медыцынскага прызначэння, лекавых і імунабіялагічных прэпаратаў, клетачных і малекулярна-біялагічных тэхналогій;
• стварэнне новых тэхналогій прафілактыкі захворванняў на аснове выкарыстання біялагічна актыўных дабавак, іншых лекавых сродкаў;
• маніторынг і прагназаванне стану навакольнага асяроддзя;
• рэабілітацыя радыеактыўна забруджаных зямель;
• механізмы адаптацыі арганізма чалавека да дзеяння фактараў навакольнага асяроддзя;
• ахоўныя меры па пераадоленні аддаленых радыеэкалагічных і медыка-біялагічных наступстваў Чарнобыльскай катастрофы;
• функцыянаванне біясістэм, біятэхналогіі, хімія-і імунапрафілактыка і тэрапія інфекцыйных і неінфекцыйных захворванняў, імуналогія, малекулярная біялогія, біяхімія;
• вывучэнне ўплыву хімічных, фізічных і біялагічных фактараў асяроддзя пражывання;
• таксіколага-гігіенічная ацэнка новых хімічных рэчываў, кампазіцый і рэцэптур, што ўкараняюцца ў народную гаспадарку і ахову здароўя.